近日,我院张永华课题组与中国科学院西双版纳热带植物园孟宏虎副研究员合作在国际期刊《BMC Plant Biology》(SCI二区top,IF=4.3)上发表题为“Plastome evolution of Engelhardia facilitates phylogeny of Juglandaceae”的研究文章。我院2024届硕士生黄悦,青年教师金鑫杰博士为共同一作,云南师范大学青年教师张灿瑜博士,浙江大学生命科学学院李攀副教授也参与了此项工作。
该文章利用Illumina测序数据,组装了8种黄杞属植物的完整质体全基因组,并结合已发表的胡桃科物种序列,探究黄杞属物种质体基因组的结构特征,研究胡桃科内三个大属(山核桃属Carya、胡桃属Juglans和黄杞属)的变异位点和分化热点区域,阐明胡桃科物种的密码子偏好性、系统发育关系和分化时间。本研究的主要贡献为今后胡桃科黄杞属物种的质体基因变异、系统发育和进化历史研究提供可靠的依据。
利用ML和BI基于质体基因组全长构建的系统发育树
研究工作得到国家科学基金项目(42171063,31800309)、浙江省公益技术与应用研究项目(LGN21C020007)、云南省兴滇英才支持计划(XDYC-QNRC-20220028)、云南基础研究项目(202301AU070145)和中国科学院西双版纳热带植物园“十四五”规划(XTBG-1450101)的资助。
论文下载链接:https://doi.org/10.1186/s12870-024-05293-0